Por el año 1994, un grupo de hermanos del distrito pastoral Vitarte, liderados por el Pastor Josué Muñoz, con el ánimo de establecer un centro de atención múltiples y orientación espiritual para los interesados de la Zona, se adquirió una casa departamento en la Urbanización Los Portales de Javier Prado. Este grupo de líderes, pronto se dio cuenta que la mayor necesidad para los hogares era una educación cristiana; puesto que los que hacían esfuerzos extraordinarios eran muy pocos, al enviar a sus hijos a una Institución Adventista surcando la distancia y una serie de dificultades que significaba enviar a los Colegios como Miraflores, España y Colegio Unión, quedando privados la gran mayoría de este privilegio de la Educación Cristiana.

Los líderes y profesionales de este populoso distrito conscientes de esta gran necesidad, tomaron la iniciativa de recolectar el número de educandos para los niveles de inicial, demostrándose de esta manera la posibilidad de iniciar gestiones de la Creación de un Centro Educativo con los niveles de Inicial y Primaria, ante la Unidad de Servicios Educativos N° 0014 de Ate Vitarte. Gracias al apoyo de la Asociación Peruana Central en la Pastor Francisco Lozano Cusi, como representante legal de la promotora en ese entonces Secretario, se entrega el expediente N° 7953- 94 con 61 folios y demás documentos.

Oficializándose nuestra creación después de casi dos años de perseverancia en el gran sueño de una Institución Educativa en Vitarte. Se resuelve la autorización un 04 de julio de año 1996, con RD Nº 1394 en vías de regularización a partir del 1º de abril del año 1995, como Centro Educativo de Gestión No Estatal “Los Portales del Saber”, con los Niveles de Inicial y Primaria Completa; actuando como Directora Doña Rosa Medina Albarrán y Coordinadora denominacional doña Cecilia Gamarra Azabache. Formando parte de la Asociación Educativa Adventista Central Sur a partir del año 1997, año de su constitución del ASEACES.

En el 4to año de su funcionamiento (1998), surgieron algunas dificultades económicas y la imposibilidad de sostenimiento por la poca cantidad de estudiantes la administración de la APC Sur y ASEACES toman el voto de cerrar el servicio educativo, sin embargo, por la perseverancia y fe de algunos hermanos padres de familia, se continuó con la matrícula a manera de desafío. Gracias a Dios bajo la dirección del Prof. Pedro Chuquista Navarro el año 1999 se alcanzó más de los 50 estudiantes que era requisito para seguir con el servicio. Asimismo, para el año 2000, el número de estudiantes se duplicó (110) igualmente el número de docentes (06), surgió la necesidad de ampliar aulas en el tercer piso, sin embargo, para el año 2001 el número de estudiantes ya se triplicaba, quedando muy pequeño el local escolar en Calle Suecia Nº 140 de la Urbanización Los Portales de Javier Prado, una bonita zona e ideal para un Centro Educativo. Sin embargo, la Junta Escolar presidida por el Pastor Samuel Idrogo, y con la aprobación de la APC Sur, deciden hacer el traslado de local a la Iglesia Central de Vitarte, logrando comprar un terreno contiguo para el patio escolar, gracias al apoyo de un proyecto de ADRA que dedicó la recolección del año 2001, a la compra de este terreno.

Ese mismo año se inició las gestiones de cambio de local y ampliación del Nivel Secundario ante la UGEL 06 de Ate Vitarte, después de cumplir una serie de requisitos indispensables resuelve el traslado del local y la ampliación al Nivel Secundario por R:D. Nº 00752, un 1º de marzode 2004. Contábamos ya en ese año 240 estudiantes en los tres niveles y 20 profesores y personal administrativo.

El año 2005 hubo un cambio de administración, tomando la posta en la dirección del Plantel el Licenciado Jorge Mercado Cárdenas. El 2006 contábamos en los tres niveles 315 estudiantes y 21 docentes y personal administrativo, dirigidos por el Licenciado Juan Obispo Cárdenas. El 2008 y 2009 dejó su huella de esfuerzo, la maestra Flor Flores Ramos, en su gestión Dios bendijo a nuestra institución en varios aspectos. El 2010 asumió el desafío del liderazgo el Licenciado Daniel Rosas. Para el 2011, retomo la posta el Lic. Pedro Chuquista Navarro, y para los años 2012 y 2013 asume la dirección el Lic. Héctor Medina Sánchez. En el año 2014 dirigió la institución la directora, Lic. Susana Quispe Ccalla, 340 estudiantes y 28 trabajadores entre docentes y personal administrativo. En el año 2015 al 2017 dirigió la institución educativa el Lic. Dino Barrientos Velito, 283 estudiantes y 24 trabajadores entre docentes y personal administrativo en el año 2018 al 2021 dirigió la institución el Lic. Luis Miguel Llanos Ponce, en la actualidad vienen siendo dirigidos por el Dr. Queleon Elmer Mamani Quispe.

Podemos testimoniar que la existencia de esta Institución Educativa fue por voluntad de Dios, porque pese a tantas dificultades económicas y técnicas, Dios permitió que las circunstancias fueran favorables y apoyadas por nuestras autoridades administrativas y hermanos que apoyaron económicamente para que se cuente con aulas y laboratorios indispensables para su funcionamiento. Nuestro agradecimiento en primer lugar a Dios y a la Administración de la Asociación Peruana Central Sur, a la Asociación Educativa Adventista Central Sur, a los pastores distritales comprendidos en el Distrito escolar como son Vitarte, Santa Anita, La Molina, Huaycán, Huachipa, El Agustino, entre otros, a los líderes eclesiales e iglesia Vitarte Central, a la comunidad educativa de LPS, por ser los instrumentos oportunos en la gestión educativa. Queremos destacar nuestra gratitud a nuestros queridos padres de familia que confiaron a sus hijos en el sistema educativo adventista con esperanza y compromiso con el futuro de sus menores hijos.